靈活的模塊化硬件
scanR篩選工作站將基于顯微鏡設置的模塊化和靈活性與高內涵篩選需求的自動化、速度和效率相結合。模塊化設計適合標準分析和分析開發,讓scanR工作站適用于研發應用或多用戶環境。
綜合性軟件
scanR解決方案靈活開放的設計讓其成為日常和*級應用的有效工具。其旨在滿足現代細胞生物學、分子生物學、1.系統生物學和醫學研究中的定量成像和圖像分析要求。
2.生物樣品的全自動圖像采集和數據分析
3.針對多孔板、載玻片和定制陣列而設計
4.用于生物功能測定的強大分析模塊
5.適合分析開發和高內涵篩選
6.可用于固定細胞和活細胞
分析示例
在藥*發現篩選中,已建立的協議可用于顯示化合物在細胞水平的生物化學作用。可以利用一系列標準化分析準確評估基因表達水平的藥*誘導變化。scanR解決方案在測量細胞凋亡、微核或DNA片段化(彗星試驗)的常規篩選方面表現出色,并涵蓋了許多研究領域的各種篩選應用。
·細胞計數
·基因表達
·細胞內運輸
·易位
·細胞增殖
·早幼粒細胞白血病(PML)身體測定
·細菌和病毒感染試驗
·細胞周期分析
·細胞陣列篩選
·蛋白質定位和共定位
·包括動力學分析以及對所得響應曲線圈門的活細胞測定
·多色分析
·稀有事件分析
·自動FISH分析
·組織切片中的熒光分析
·細胞遷移
靈活的模塊選項
scanR的設計不僅滿足全自動高內涵篩選系統的特定速度、耐久性和可靠性要求,還具備無y倫b的靈活性和適應性以及廣泛的擴展能力。這些讓scanR能夠匹配任何應用和預算的規范要求。其他選項列表包括諸如基于深度學習技術的自主學習顯微鏡模塊、使用動力學模塊測量動力學參數的模塊、高速3D反卷積模塊、基于IX83的紅外(IR)激光硬件自動聚焦的集成ZDC等等。
圈門和分類
1.基于流式的強大數據分析概念已成功應用于大圖像數據集分析的需求。
2.多維圖像數據以二維散點圖或一維直方圖顯示;可使用圖形工具選擇感興趣的聚類數據群
3.來自不同散點圖的圈門可以與布爾運算組合創建復雜分類方案
分層圈門方法可以直觀地選擇群,也可以直接畫廊展示。
目標檢測與分析
1.強大的目標檢測模塊可以分割細胞核、細胞或其他結構
2.選擇多種檢測算法并根據感興趣的目標進行調整
3.基于分割結果,可從超過100個目標參數列表中選擇所要提取的特征
4.助力各類基于細胞的分析
下面圖像截屏詳細說明了scanR采集數據后對圖像的檢測和分割。由德國海德堡EMBL R. Pepperkok博士提供。
即時質量控制
1.圖像和目標與其相關數據點相互關聯:
2.單擊數據點則會在顯示窗口中加載相關圖像并突出顯示相關對象
3.單擊圖像顯示窗口中的對象可突出顯示散點圖和直方圖中的相關數據點
4.創建門控數據群或選定的所有圖像的圖庫視圖,從而便于將大圖像集與相關信息進行直接、可視化的比較
結果會在熱圖中可視化顯示或輸出到表格中。顯示全孔概覽非常簡單。
用動力學模塊測量動力學參數
1.可以通過時間變量對活細胞、細胞核和其他目標進行分類
2.根據隨著時間推移測量的值(諸如強度、面積、比率、形狀因子等平均靜態參數)評估跟蹤曲線
3.隨著時間變化評估和分析諸如強度或熒光標記強度、位置、大小或形狀等靜態參數
4.曲線濃縮為單一特征值(動力學參數)
5.在1D或2D直方圖中繪制動力學參數,并根據其特定的時間變量繪制門群
表達FUCC(CA)生物傳感器的hES細胞。由英國倫敦弗朗西斯克里克研究所Silvia Santos博士提供。
兩個系統的故事
1.在與scanR解決方案相同的系統上運行奧林巴斯cellSens活細胞成像軟件,您就可以同時使用相同的設置進行篩選和*端成像
2.利用2D和3D約束迭代反卷積算法,為苛刻的篩選應用獲取接近共焦品質的圖像細節
3.快速且便利的算法可以消除離焦模糊以及背景,從而突出重要的結構細節
4.有助于進行要求高分辨率結構細節的深度分析
自主學習顯微鏡
經過*次性培訓階段之后,scanR AI能夠讓系統通過將所學習的分析協議整合到基于分析的工作流中實現新數據的自動分析。由于用戶在訓練實驗的設計上掌握*全控制權,并且在訓練階段可以加入許多具有挑戰性的分析條件,因此提高了分析結果的準確性和魯棒性。所學到的AI分析協議可以通過軟件*有的數據探索和分析界面進行深入、輕松的驗證,確保您對AI結果充滿信心。
使用自主學習顯微鏡生成的AI模型對無熒光染色的明場圖形進行分析。Hela細胞的細胞核在訓練階段進行GFP標記,以此顯示系統如何對明場圖像進行分析。一種*新思維方式自主學習顯微鏡為高內涵分析拓展了*新的視野。應用范圍涵蓋了從以前不可能完成的圖像分割任務到極低信號水平的定量分析、簡化染色方案、無標記分析等。
應用示例:在不同信號水平下對細胞核的強大分割,能夠大幅減少定量分析的曝光量。
技術參數
項目 | 參數 |
scanR篩選系統 | 基于顯微鏡的生命科學應用篩選系統平臺 靈活性:可根據應用要求*確調整系統配置 性能和耐用性:*端系統整合理念,實時部件并聯運行,使得滿足高通量篩選應用的平臺開放性和可靠性優勢合二為一 滿足篩選應用的吞吐量和可靠性需求 |
顯微鏡鏡架 | 奧林巴斯倒置*端顯微鏡IX83,單層或雙層機架 電動載物臺, 適用于IX83的MarzhauserSCAN IM 120 x 80 |
熒光LED選項 | Lumencor SpectraX: 6個獨立的LED通道 CoolLED pE-300ultra: 3個獨立的LED通道 針對應用優化的帶通濾光片 壽命> 20,000小時 |
透射光 照明選項 | 透射照明僅用于目視觀察(無透射光篩選) 適用于篩選和目視觀察的透射光照明,包括快門(支持透射光篩選) 可選DIC(微分干涉)或相襯觀察 |
硬件控制以及 系統同步 | 帶有單獨CPU的實時控制器,獨立于成像PC計算機的操作系統 時間分辨率: 1毫秒 計時精度: < 0.01毫秒 硬件同步多任務采集(照明控制、發射濾光片、快門等) 通過外部觸發器*確控制相機 |
相機選項 | Hamamatsu ORCA FLASH 4.0 V3,配有大型18.8 mm傳感器芯片的高靈敏度冷卻sCMOS相機 Hamamatsu ORCA FLASH 4.0 LT PLUS,配有大型18.8 mm傳感器芯片的高性價比sCMOS相機 Hamamatsu ORCA R2,高靈敏度冷卻CCD相機 Hamamatsu C8484,高靈敏度CCD相機 |
物鏡選項 | “薄”底(0.1 - 0.2 mm)厚度的蓋玻片和玻璃底板(2x,4x,10x,20x,40x,60x,100x)的物鏡 “厚”底(~1 mm)厚度的塑料底板和載玻片(2x,4x,10x,20x,40x,60x)的物鏡 “薄”底的(0.1 - 0.2 mm)厚度的蓋玻片和玻璃底板(10x,20x,40x)的相襯物鏡 “厚”底的(~1 mm)厚度的蓋玻片和玻璃底板(10x,20x,40x)的相襯物鏡 |
濾光片組 | 單帶通濾光片組(根據要求提供規格) 多帶通濾光片組(根據要求提供規格) |
scanR系統 軟件 | 2個獨立軟件模塊:scanR采集軟件和scanR分析軟件 陰影校準流程,彌補采集時或采集后的陰影并優化局部熒光強度的均勻性 軟件模塊可以安裝在相同或不同的工作站上(64位Windows 10系統 ) |
scanR采集 軟件 | 面向工作流的配置和用戶界面 功能強大的軟件自動對焦程序可與選配紅外激光硬件自動對焦功能、二步粗和細自動對焦、基于對象的自動對焦或基于圖像的自動對焦結合使用 具有預定義格式(載玻片、多孔板)的板管理器,和用于創建和編輯自定義格式(斑點陣列)的編輯界面 用于補償陰影并優化空間強度均勻性的陰影校正 時間序列篩選,Z-stack篩選,多色篩選(無的采集通道) 支持集成到自動化樣品制備線中,例如用于液體處理的腳本化接口 |
scanR分析 軟件 | 用于標準測定和測定開發的自動化圖像和數據分析 在線和離線多核分析 圖像處理、圖像分析、顆粒檢測、參數提取和計算 細胞計數數據探索、分析、圈門和分類 強大靈活的圈門概念 ,包括自動化群檢測等 數據點、對象和圖像之間的直接關聯 基于分析的工作流和*的科學分析開發功能 |
計算機 | 成像計算機(*新*代PC計算機),64位Windows 7 操作系統 |
其他選項 | scanR AI深度學習解決方案 延時動力學分析模塊 - 一種*特的細胞計數方法,可以更好地分析和了解活細胞動力學 3D反卷積模塊(需要64位操作系統) 配有一個或兩個攝像頭的Yokogawa®CSU-W1®共聚焦選項 兩個攝像頭同時采集 基于奧林巴斯IX83顯微鏡系列ZDC的紅外激光硬件自動對焦功能 cellVivo孵育系統 板載機器人 編碼變倍器IX3-CAS 用于“Sedat”配置高速成像的快速發射濾光片轉盤(FFWO) 定制:硬件、軟件、分析 其他scanR分析工作站 scanR分析軟件的第er個許可證 |
一套設置包含2個系統 | 可與cellSens活細胞成像軟件結合使用,從而實現*端成像系統的q面通用性 |