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你還搞不清楚病毒載體的用法?

2021
11-18

10:17:35

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來源:上海古朵生物科技有限公司

基因表達(dá)載體是廣大科研人員普遍需要的研究工具,而病毒載體憑借其優(yōu)良效能則越來越成為最shou歡迎、也最為普遍的基因表達(dá)載體。然而病毒載體也分為好幾類,不同實(shí)驗(yàn)類型、不同研究目的、不同“受體”性質(zhì)需要我們準(zhǔn)確評估與選擇。因此,詳細(xì)了解不同病毒載體的相關(guān)知識是我們科研人員必須掌握的。本文詳細(xì)介紹了常見病毒載體的原理、特點(diǎn)和適用范圍。


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一、慢病毒載體慢病毒(Lentivirus)屬于逆轉(zhuǎn)錄病毒的一種,有由于其感染潛伏期較長,臨床癥狀發(fā)展緩慢,被稱為慢病毒。而慢病毒載體則是在慢病毒的基礎(chǔ)上改變重組其構(gòu)成原件,進(jìn)而在去除其生物危害性的同時,利用其高感染等性能表達(dá)目的基因。人類免疫缺陷病毒(HIV)是常見的慢病毒載體改造原型。如下以HIV中最為常見的HIV-1型:

HIV-1為雙鏈RNA病毒,主要組分包含三種重要病毒核心基因:gag(編碼結(jié)構(gòu)蛋白或稱為核心蛋白),pop(編碼復(fù)制相關(guān)酶類),env(編碼包膜糖蛋白);調(diào)節(jié)基因:tat(轉(zhuǎn)錄控制)和rev(表達(dá)調(diào)節(jié));四個輔助基因:vif、vpr、vpu、nef(作為毒力因子參與宿主細(xì)胞的識別和感染);兩端為長末端重復(fù)序列LTR (內(nèi)含復(fù)制所需的順式作用元件)。

第一代慢病毒載體為雙質(zhì)粒系統(tǒng),基本保留了HIV的所有組件,產(chǎn)毒滴度低,復(fù)制缺陷,且存在產(chǎn)生復(fù)制能力的活性HIV病毒的可能;第二代慢病毒載體為三質(zhì)粒系統(tǒng),分為包裝質(zhì)粒、包膜質(zhì)粒和載體質(zhì)粒,其中使用水泡性口炎病毒糖蛋白(VSV-G)基因替代env基因,拓寬了病毒的感染宿主細(xì)胞范圍,雖然三質(zhì)粒降低了病毒重組的可能,但是由于其依然保留HIV大部分附屬基因,產(chǎn)生活性HIV依然存在可能;第三代慢病毒載體則去除了HIV病毒所有輔助序列,只保留核心的3個基yin(gag、pol、rev),病毒RNA不能轉(zhuǎn)錄,故意外重組的可能性很低;第四代慢病毒載體為四質(zhì)粒系統(tǒng),即將病毒核心基因分散在多個質(zhì)粒中(pGag/Pol、pRev、pVSV-G和載體質(zhì)粒),同時去除tat,故病毒重組、產(chǎn)生活性病毒的可能進(jìn)一步降低,同時四質(zhì)粒系統(tǒng)中的載體質(zhì)粒中可以包含可誘導(dǎo)基因,使得該基因表達(dá)系統(tǒng)可以條件性調(diào)控。

慢病毒載體感染能力強(qiáng)、且宿主廣泛(分裂和非分裂細(xì)胞);能夠整合進(jìn)宿主DNA且篩選后穩(wěn)定遺傳;表達(dá)潛伏期短,一般細(xì)胞24h-48h、體內(nèi)96小時可表達(dá);慢病毒載體可以插入組織特異性啟動子或增強(qiáng)子;慢病毒攜帶基因的長度大致無5kb以內(nèi)。由于慢病毒依然是HIV來源,自然宿主是人,依然存在潛在的生物毒性,故操作時避免直接接觸人體。慢病毒載體適合常見類型的體外研究(細(xì)胞),包括過表達(dá)、敲除、敲低都基因干預(yù)操作,但慢病毒載體不適合于體內(nèi)研究,因?yàn)槠涞味炔荒軌驖M足體內(nèi)用量且免疫原性較強(qiáng)。

二、腺病毒載體腺病毒(Adenovirus)是一種線性無包膜的雙鏈DNA病毒,腺病毒的衣殼結(jié)構(gòu)可以分為五鄰體和六鄰體兩部分,腺病毒的基因組主要包括病毒DNA復(fù)制前期的Ela、Elb、E2a、E2b、E3、E4(編碼病毒調(diào)節(jié)蛋白)和DNA復(fù)制后期的Ll~L5(編碼病毒結(jié)構(gòu)蛋白),以及兩端的反向重復(fù)序列,ITRs(包裝所必需的順式作用元件)。

在天然腺病毒(主要是人5型腺病毒)的基礎(chǔ)上改造而得的腺病毒載體,其基因攜帶量增加,感染效率增加,且生物毒性降低。第一代腺病毒載體是刪除Ela、Elb基因的復(fù)制缺陷病毒,其復(fù)制必須在表達(dá)E1蛋白的細(xì)胞中,病毒滴度高且穩(wěn)定,不整合宿主基因組,但包裝量少(約為4.5kb),免疫原性強(qiáng);第二代腺病毒載體進(jìn)一步刪減病毒原有基因,在減少免疫原性和細(xì)胞毒性的同時,進(jìn)一步提高載體容量,可以達(dá)到14kb,但是病毒滴度較低;第三代腺病毒載體則只保留了ITRs和包裝信號序列,因此其攜帶外源基因容量更大,約36 kb,但由于病毒包裝基因必須基因被刪除,第三代腺病毒載體工作組裝需要輔助病毒(表達(dá)腺病毒裝配必須基因),第三代腺病毒載體容量大,免疫原性低,但是量產(chǎn)困難,存在輔助病毒污染風(fēng)險。

腺病毒感染力強(qiáng)、宿主范圍廣(分裂和非分裂細(xì)胞),表達(dá)迅速(24h-48h)且表達(dá)量高,包裝容量大,但腺病毒不能整合入宿主基因組內(nèi),規(guī)避了整合入宿主基因組的生物風(fēng)險,安全的同時也形成了細(xì)胞分裂過程中不能均等分配給子細(xì)胞。腺病毒載體適合一般體外實(shí)驗(yàn),使用細(xì)胞類型較多,免疫原性較強(qiáng),不適合體內(nèi)實(shí)驗(yàn)。

三、腺相關(guān)病毒腺相關(guān)病毒(Adeno-associated virus,AAV)是無包膜單鏈線狀DNA 缺陷型病毒,外包二十面體衣殼蛋白,基因組包括兩端的反向重復(fù)序列ITR(包含復(fù)制和包裝所需的唯1順式作用元件),中間的兩個核心基因:Rep 基因(編碼參與病毒復(fù)制、包裝和基因整合的蛋白),Cap(編碼結(jié)構(gòu)蛋白VP1、VP2、VP3)。AAV為復(fù)制缺陷病毒,不能獨(dú)立存在,其復(fù)制增殖需要輔助病毒作用。衣殼蛋白不同的AAV病毒,對組織器官的親和力不同,形成各種AAV血清型:如AAV1較易感染骨骼肌,AAV6較易感染肺部,AAV8則親嗜肝臟,AAV9則為神經(jīng)和外周組織(見后表)。

腺相關(guān)病毒載體(重組腺相關(guān)病毒載體, rAAV)的發(fā)展同樣在天然AAV的基礎(chǔ)上不斷優(yōu)化改進(jìn)。最早采用重組載體質(zhì)粒、目的基因質(zhì)粒、輔助質(zhì)粒、腺病毒共轉(zhuǎn)染細(xì)胞,步驟多、產(chǎn)率低、風(fēng)險高;隨后采用目的基因載體、AAV基因載體(rep/cap)、輔助質(zhì)粒(包含E1a、E1b、E2a、E4、VA等能完成腺病毒相似輔助功能的基因元件)共轉(zhuǎn)染細(xì)胞,但包裝效率低,生物風(fēng)險高;Ad/AAV嵌合載體、輔助質(zhì)粒感染恒定表達(dá)Rep/Cap細(xì)胞系的方法以及AAV生產(chǎn)細(xì)胞系法,這些方法均操作繁瑣;目前最chang用的載體方法為Bac-to-Bac桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng):將rAAV包裝組分AAV2的Rep基因序列、Cap基因序列、以及ITR-目的基因表達(dá)框的序列分別構(gòu)建到三個桿狀病毒中,分別轉(zhuǎn)染昆蟲細(xì)胞Sf9各自擴(kuò)增,然后通過共感染Sf9細(xì)胞來生產(chǎn)rAAV,該方法可以量產(chǎn)、成本低、操作簡單且不會對人體產(chǎn)生損傷。

AAV載體免疫原性極低,非常適合動物實(shí)驗(yàn),感染效率高,宿主范圍廣(分裂和不分裂細(xì)胞),不整合到基因組,穩(wěn)定表達(dá)持續(xù)時間長(半年以上),但是表達(dá)水平低且慢(細(xì)胞需要1周,動物需要2周),攜帶目的基因片段約為2kb。


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