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古朵生物提供基因合成定制服務!
閱讀:123 發(fā)布時間:2020-5-21客戶提供
基因序列或蛋白質(zhì)氨基酸序列
zui終交付
約4 μg含有目的片段的高純度凍干質(zhì)粒DNA;
含有重組質(zhì)粒的穿刺菌一管;
發(fā)貨文件主要包括如下內(nèi)容:測序結(jié)果、COA報告、sqd文件。
備注:默認合成克隆基因至pUC57載體
鄭重承諾:對客戶提供的核酸/氨基酸序列或基因合成的結(jié)果沒有所有權(quán),并承諾對結(jié)果嚴格保密,且不會以任何形式散布到第三方。
載體選擇主要考慮下述3點:
1、構(gòu)建DNA重組體的目的,克隆擴增/表達表達,選擇合適的克隆載體/表達載體。
2、載體的類型:
(1)克隆載體的克隆能力-據(jù)克隆片段大小(大選大,小選小)。尤其對于病毒載體來說,載體包裝容量的大小是評估能否成功包裝病毒的首要因素。
①腺病毒可以插入長約8kb的外源基因。目前,我們包裝過長度為7.5kb外源基因的腺病毒。
②慢病毒的包裝容量約為6kb(包含載體帶有的其他抗性基因或報告基因),但是2kb以上的外源基因包裝慢病毒難度就增加了,增大1kb會下降1個單位數(shù)量級的滴度,故2kb以上的基因包裝慢病毒需要進行評估。此外,毒性蛋白、凋亡蛋白和膜蛋白(作為受體、轉(zhuǎn)運蛋白行使功能)等由于其本身的功能,包裝可能會有一定難度。
③AAV的總包裝容量是4.7 kb(包含載體中兩個ITR約0.3kb +具體啟動子 + 內(nèi)含子約0.6kb + 具體熒光標簽 + polyA約0.2kb),所以插入目的基因一般約2kb 左右。由于AAV包裝容量有限,目的基因大于2kb,可考慮去除內(nèi)含子,因為內(nèi)含子只是有助于插入的目的基因穩(wěn)定表達。
(2)確定表達蛋白的目的,然后再來選擇優(yōu)勢的表達質(zhì)粒。一般分為原核表達和真核表達質(zhì)粒,前者主要用于體外純化蛋白,如帶His-tag的PET系列,帶GST-Tag的PGEX系列,選用不同的表達載體,就得建立相應的純化系統(tǒng),包括緩沖液的配置、珠子/柱子的選擇等等,還得考慮目的蛋白的可溶性,一般大tag的融合蛋白可溶性要好一些,如GST的。這種原核純化的蛋白一般用來制備單一的、需要量大的蛋白。真核表達載體一般是細胞、體內(nèi)表達等需要時所用,只需要將它放到細胞或體內(nèi)細胞即可,唯1考慮的是它的啟動子的選擇,常用都是cmv啟動子的,表達效率較高,也有多種啟動子經(jīng)過改造的表達載體,一般用來表達需要調(diào)控表達時間及表達量的蛋白。
3、載體MCS中的酶切位點數(shù)與組成方向因載體不同而異,適應目的基因與載體易于連接,不產(chǎn)生閱讀框架錯位。
①選分子量小的質(zhì)粒,即小載體(1-1.5kb)→不易損壞,在細菌里面拷貝數(shù)也多(也有大載體);
②一般使用松弛型質(zhì)粒在細菌里擴增不受約束,一般10個以上的拷貝,而嚴謹型質(zhì)粒<10個;
③必需具備一個以上的酶切位點,有選擇的余地;
④必需有易檢測的標記,多是抗生素的抗性基因。