⑴微波對藥物加熱迅速而均勻、干燥速度快、時間短。由于是在濕物料內部加熱，熱傳遞方向與濕分傳遞方向*，水分從物料中心向兩側擴散，路程比傳導加熱要少一倍，有利于提高物料干燥速率、縮短干燥時間。由于微波能直接為水分所吸收，物料內部和表面的水分能同時獲得微波而被加熱，所以加熱均勻、且干燥時間短，不影響被干燥物料的色香味及組織結構。例如將含水量從80%烘干降至20%時，用熱空氣干燥需20h，而用微波干燥僅需2h即可。又如用傳統烘房干燥400~500kg的丸藥，水丸需20h左右，蜜丸平均約需6h，而采用微波加熱干燥，水丸僅需4~5h，蜜丸約需1h。烘干*時，原工藝至少需20d，而微波工藝只需7d。且有一定膨化作用，更利于人體吸收。
⑵選擇性加熱，干燥溫度低，產品清潔，干燥及滅菌效果好、質量高。在微波干燥中不同物質吸收微波的能力亦不相同，其中水分比其他一些固體物料具有更大的吸收能力，所以利用微波對含水物料的干燥特別有利，濕物料中水分獲得較多能量而迅速汽化，而固體物料因吸收微波能力小，溫度不會升的很高。而且在干燥的同時兼有滅菌殺蟲等效果，從而提高了產品質量。獲得的成品含水量均勻，清潔無菌，表面不結殼、皺皮或開裂等，干燥效果較理想。經微波處理后的丸藥，含菌數比未處理者降低了78%~99%，比烘房處理者降低15%~90%。用微波對藥物進行低溫滅菌一般僅需幾十秒至幾分鐘，而且干燥溫度一般在80℃以下，主要成分基本不受影響，可保證療效。如雞骨草丸制劑顆粒經微波滅菌前后的紫外吸收光譜和熒光光譜基本*，說明微波干燥對藥物的主要成分無明顯影響。又如在很多口服液中都含有營養物質，經高溫滅菌后雖然達到了衛生學檢查的要求，但同時大都破壞了其中的營養成分，易產生沉淀，并帶有較濃的焦苦味。而用微波進行處理，可以保持原營養成分，口感好，色澤澄清，無沉淀，滅菌效果好。
⑶耗能少、成本低 由于熱量直接生產于濕物料內部，所以熱損失少、熱效率高，一般可達80%左右。如用電熱干燥某物料耗電100KW，而用微波干燥同量同濕度的物料，耗電20KW即可達到同樣干燥程度。微波耗能僅占傳統蒸汽和烘箱耗能的1/3，節約大量能源，生產成本降低。
⑷環境好、無污染 微波加工無環境和噪音污染，加工車間內無悶熱的高溫和蒸汽彌漫，大大改善了工人的工作環境。
⑸操作簡便、生產效率高。 用微波處理藥物可以連續操作，提高了生產效率，便于自動化生產和企業管理。改善了工作環境和條件，設備操作方便、控制靈敏。因微波是由電能轉換而來，開通電源熱即產生，進行干燥，斷開電源，熱源立即消失。不需預熱、亦無余熱。而且微波設備結構緊湊，占地小，減少了配套設施。
